吉凯基因牵头主持上海张江国家自主创新示范区专项发展资金重大项目

2020-10-23

2020年10月,吉凯基因携手中国科学院上海营养与健康研究所、上海生物信息技术研究中心共建的“基于医学大数据挖掘的药靶发现和筛选平台”项目,入选上海张江国家自主创新示范区专项发展资金重大项目。签约仪式于10月22日在上海推进科技创新中心建设办公室举办。该项目将验证GRP2.0体系的可靠性及数据共享创新运营模式的可行性,并最终成为国家生物医学大数据基础设施(上海)的前沿技术应用示范。

GRP(Good Research Practice)平台,是吉凯基因搭建的标准化、工程化、系统化(“三化”) 药物靶标发现与验证平台。该平台以高效、可靠的工作模式打通了临床需求与基础科研之间的鸿沟,形成了药物靶标持续标注和筛选体系。历经十余年的积累,吉凯基因通过GRP平台,已得到近千个经多层次验证的、全新的候选靶标基因。

药物靶标的发现是新药研发、乃至整个生物医药产业的源头创新,中国的生物医药行业亟待形成药物靶标开发能力。药靶发现高度依赖于对疾病机理的深入研究,其时间周期长达数十年,其中一个重要原因是需要对各种类型、不同来源的海量的基础研究数据进行关联、整合及重复验证。据2012年和2016年发表于全球基础科研权威杂志Nature的综述报道,全球范围内基础研究实验数据的可重复率不足20%。造成实验数据可重复率过低的主要原因是缺乏统一的实验标准与数据标准。因此,基础研究数据的质量低下、数据孤岛化成为靶标发现工业化进程的重大掣肘。

吉凯基因持续18年打造的GRP(Good Research Practice)平台,将药靶发现阶段基础研究进行标准化、工程化、系统化构建,大幅提升了数据的可重复性,第一次实现了靶标发现的工业化,将靶标发现从小概率、高风险事件转化成了规模化、系统化的工业过程。目前已形成多层次的药物靶标持续标注和筛选体系,得到近千个经多层次验证的、全新的候选靶标基因。与此同时,中科院上海营养与健康研究所生物医学大数据中心已建成国家生物医学大数据基础设施(上海),形成一定规模的存储计算与网络服务能力、数据收集存储挖掘能力以及信息共享能力,正在推进进行前沿技术与应用示范工作。

百尺竿头更进一步。近年来,依托GRP平台,吉凯基因与合作伙伴开始探索引入区块链和人工智能的技术,搭建生物医药大数据联盟链、开展数据共享模式探索,打造整合临床研究大数据系统、本地文献资源库及知识图谱、多组学数据分析云平台的药靶发现和新药研发体系,构建GRP2.0体系。

本次入选上海张江国家自主创新示范区专项发展资金重大项目的“基于医学大数据挖掘的药靶发现和筛选平台”,将进一步扩大研究标准化进程,结合区块链与人工智能等新兴信息技术,探索具有更高共享度的生物医药大数据运营模式,形成基于GRP平台的升级版的药靶发现和新药研发体系。