免疫组库(immune repertoire，IR)是指在任何指定时间，某个个体的循环系统中所有功能多样性B细胞和T细胞的总和。TCR/BCR是T/B淋巴细胞表面的特征性标志物，作用是识别抗原，基本单位都是由C/V/D/J四个基因簇编码；细胞发育过程中存在复杂的V(D)J重排机制，导致TCR/BCR基因序列多样性极其丰富，这些序列多样性的集合称为免疫组库。

传统的免疫组库研究技术通常是用多重PCR技术或5’RACE扩增决定B细胞受体（BCR）或T细胞受体（TCR）多样性的互补决定区（CDR3区），再结合高通量测序技术实现，但往往只能检测TCR和BCR一条链的序列信息。BD Rhapsody VDJ全长捕获平台，不仅可以或得全长重链/轻链配对的BCR序列，以及α/β链或者γ/δ链配对的TCR序列，不仅包含了多样性最高CDR3区域，更是覆盖了完整的FR1-4区域以及CDR1-3区域，可以从分析结果中轻松获取V/D/J片段的完整序列以及基因注释信息。

通量高：8通道型号的芯片，一次可以实现8个样本同时上机检测，每个通道最高可以上机细胞数40000个；

信息全面：可以同时获得单个细胞的mRNA信息和TCR/BCR信息；

可检测罕见细胞类型：不仅可以分析常见的α/β T细胞，还可以分析罕见的γ和δ T细胞。

1、揭示克隆性、多样性、抗原特异性和细胞环境；

2、组装并注释全长V(D)J基因序列；

3、从单个T细胞识别α和β链序列，并可匹配TCR/BCR双链；

4、可以将TCR/BDR与对应的细胞内的转录组信息进行合并分析。

1、免疫组库可以捕捉肿瘤发生时免疫微环境的变化，寻找免疫治疗的靶点，从而辅助免疫治疗更好的抗击肿瘤；

2、器官或者骨髓移植时，经常会诱发宿主排斥反应的发生，从而发生慢性移植抗宿主病，研究其中的免疫发生过程；

3、自身免疫免疫性疾病中免疫细胞的作用；

4、免疫组库在感染性疾病、抗体开发、用药及疫苗评估等多个方面均有应用价值；例如通过免疫组库研究，可以检测感染类疾病过程中的免疫动态变化；

5、在抗体开发方面，可以获得特征性的BCR（Ig）序列，缩短抗体开发的流程；

6、针对某种疾病用药后的外周血样本进行评估，确认药物是否激发免疫反应及其功效。

研究目的： 利用单细胞RNA测序探索胃癌异质性在免疫微环境中的体现

样本信息：临床胃癌患者的手术切除样本（分选肿瘤组织以及癌旁组织内浸润的CD45+细胞）

测序策略：BD Rhapsody平台，scRNA-seq+scTCR&BCR-seq +CyTOF

捕获细胞数：＞53,768个细胞

研究结论： 相较于癌旁组织，胃癌组织内浸润了更多的耗竭性CD8+T（CD8-Tex）细胞以及免疫抑制的调节性T（Treg）细胞。在GSRCC中，CD4+和CD8+T细胞克隆的扩增情况均显著弱于non-GSRCC，并且GSRCC中的TCR共享也显著减少,B细胞向IgG型浆细胞的分化能力有所减弱。GSRCC中的免疫“静默”状态主要由T、B细胞克隆扩增受抑、细胞分化/转化受阻导致。