WES (whole exome sequencing,全外显子组测序)是指利用序列捕获技术将【全基因组的外显子区域DNA】捕获富集后进行高通量测序，能够直接发现与蛋白质功能变异相关的遗传变异SNP(单核苷酸多态性)。以人类基因组为例，虽然外显子(蛋白质编码区)只占基因组的1%，但人类基因组85%的致病突变都在外显子区域，因此具有重要意义。WES仅是对外显子区域的测序，相比全基因组测序，外显子测序更为简便，测序成本相比也会更低，测序后数据的分析也更为简单

1. 只检测外显子区域的基因变异，编码区的变异检测更准确

2. 测序深度高，可以检测罕见变异

3. 测序费用相比全基因组低，性价比高

4. 外显子区域捕获采用捕获效率更高的Agilent SureSelect exon kit

精神类疾病、心血管类疾病、代谢类疾病、免疫类疾病等多种疾病研究家系样本或散发样本研究单基因疾病或复杂疾病研究

肿瘤研究人群队列研究（GWAS、Burden等）多组学研究

研究目的：利用外显子测序探索肺腺癌肝转移（LiM）或脑转移（BrM）的突变谱和进化模式

样本信息：26例肺腺癌患者[肝转移(N=10)或脑转移(N=16)]的84份组织和血液样本

测序策略：全外显子测序

结论： 常见的驱动基因突变TP53和EGFR，在配对的原发肿瘤和转移肿瘤之间高度一致。虽然各组之间的肿瘤突变负担相当，但LiM组在配对的原发病灶和转移灶之间的突变和拷贝数变异相似度明显高于BrM组（分别为p=0.019和p=0.035）。肺腺癌脑转移与肝转移进化模式完全不同，肝转移以线性进化模式为主，而脑转移则以平行进化模式为主。

分析流程

SNP注释结果

利用ANNOVAR软件对SNP进行注释，其中包括dbSNP数据库、千人基因组计划和其他已有的数据库的注释信息，注释内容涵盖变异的位置信息、类型、保守型预测等。具体的注释内容展示如下表：

InDel注释结果

利用ANNOVAR软件对SNP进行注释，其中包括dbSNP数据库、千人基因组计划和其他已有的数据库的注释信息，注释内容涵盖变异的位置信息、类型、保守型预测等。具体的注释内容展示如下表：

CNV注释结果

利用ANNOVAR软件对拷贝数变异进行注释，注释信息包括4个部分，分别为基因及区域注释、数据库注释、ENCODE注释、结构变异信息等。具体的注释内容展示如下表：

候选基因GO功能富集分析

以下为您展示GO功能富集的结果。GO功能富集分析，会分别生成CC（细胞组件）、BP（生物学途径）、MF（分子功能）三种结果。

候选基因KEGG通路富集分析

下图展示的是KEGG通路富集的散点图，横坐标表示富集在通路中的gene占总的富集基因的比例，纵坐标表示富集的KEGG通路名称。圆点大小表示富集到该通路的基因个数，颜色表示p-value。

蛋白功能互作分析

使用genemania在线软件GeneMania（Warde-Farley D et al.2010-7）对候选基因进行蛋白功能互作网络分析,包括protein-protein, protein-DNA-genetic interactions, pathways, reactions,gene-protein expression data, protein domains-phenotypic screening profiles。 蛋白互作分析结果如下表所示：

基因-疾病表型关联性分析

依据基因与疾病的关联性强弱进行排序，如下：

样本量