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根据特异基因区域或CpG岛的序列设计实验,Bisulfite PCR扩增之后结合第二代高通量测序,能避免载体克隆测序的大量工作量和高昂成本,大大提高DNA甲基化分辨率的同时完成多个样本多个候选区域的DNA甲基化分析。
1. 使用目标区域的PCR富集和转座体介导的文库构建;
2. 可从低(1 ng)样品输入中快速生成测序文库;
3. 可以对特异基因组区域内的甲基化胞嘧啶进行精准的绝对定量;
4. 适用于高通量甲基化测序以后,特定基因或者区域的甲基化验证。
研究目的:利用启动子甲基化检测MDGA2在胃癌中优先被甲基化的生物学效应和预后意义
样本信息:原发性胃癌组织和胃癌细胞
测序策略:BSAS
结论:MDGA2在胃癌细胞和原发性胃癌中由于启动子高甲基化而普遍被沉默。MDGA2在体外通过引起G1-S细胞周期停滞和诱导细胞凋亡来明显抑制细胞增殖,并在皮下和正位异种移植小鼠模型中抑制异种移植肿瘤的生长。MDGA2的抗肿瘤作用是通过直接稳定DNA甲基转移酶1相关蛋白1(DMAP1)来介导的,DMAP1在胃癌中起到抑制肿瘤的作用。MDGA2是胃癌发生过程中一个关键的肿瘤抑制因子,其高甲基化是胃癌患者的一个独立预后因素。
分析流程