|
MTT |
MTS |
CCK8 |
产物是否可以直接用于读数 |
否,需加入DMSO |
是 |
是 |
稳定性(存放时间) |
弱 |
偏弱 |
强 |
操作简便性 |
繁琐 |
简单 |
简单 |
灵敏度 |
低 |
中 |
高 |
细胞毒性 |
强 |
强 |
弱 |
适用细胞类型 |
贴壁细胞 |
贴壁细胞、悬浮细胞 |
贴壁细胞、悬浮细胞 |
英文名称 |
5-Bromo-2'-Deoxyuridine (Brdu) |
5-Ethynyl-2'- Deoxyuridine (Edu) |
中文名称 |
5-溴-2-脱氧尿嘧啶核苷 |
5-乙炔基-2脱氧尿嘧啶核苷 |
实验原理 |
可在DNA合成期(S期)取代胸 腺嘧啶插入DNA链,而后利用抗Brdu单克隆抗体,ICC染色,显 示增殖细胞。 |
作为一种胸腺嘧啶核苷类似物,能够在细胞增 殖时期代替胸腺嘧啶(T)渗入正在复制的DNA分子中,通过乙炔基与小分子荧光叠氮染料的特异性反应快速检测细胞DNA复制活性。 |
灵敏度 |
一般 |
较高 |
DNA变性 |
需要 |
不需要 |
影响其他标记 |
是 |
否 |
优点 |
成本低。 |
1.染料是抗体1/500大小,扩散快穿透力强, 无需DNA变性;2.无需抗体,在组织和细胞 水平更准确反映DNA复制活性;3.操作简单,耗时少。 |
缺点 |
需要抗原抗体反应,抗体孵育等步骤耗时长 |
染料容易氧化,需要妥善保管 |
|
平板克隆形成 |
软琼脂克隆形成 |
原理 |
将单个细胞放入培养皿内培 养至单个细胞生长增殖并形 成细胞小群 |
将单细胞与软琼脂胶混合培养,使细胞处于不贴壁以及单细 胞状态,模拟体内细胞处于半固液态的情况,在此状态下检 测细胞克隆形成和转化的能力 |
适用细胞 |
大多数贴壁型细胞 |
非贴壁生长的细胞 |
优点 |
成本低、操作简单 |
可用于悬浮细胞、更加贴近肿瘤生长的体内环境 |
缺点 |
只用于贴壁细胞 |
成本高、操作步骤复杂、耗时长 |
表达减少:E-caheren、Desmolakin、Cytokeratin、Occludin
表达增加:N-cadherin、Vimentin、Fibronectin、Snail1、Snail2、Twist、MMP-2、MMP-3、MMP-9、Integrinv86
活性增加:ILK、GSK-3β、Rho
核堆积:β-catenin、Smad2/3、NF-κB、Snail1、Snail2、Twist
有些老师比较了解蛋白组学定量蛋白质组的流程,因此,有此问题。早期的商业服务公司,往往会将不同客户的样本放到一起,如此可以有效的节约成本。但是,我们坚决不会将不同客户的样本混合到一起上质谱。如果客户的样品来自不同物种,那么质谱鉴定的数据库选择会不同,无法进行比较。如果是同一个物种的样品,那么经过不同实验室处理后,样品里的蛋白含量和数目会有较大差别,混在一起后会影响两组不同来源的样品的蛋白鉴定数目。甚至于来源于同一组织的不同细胞系一般也不推荐放在一起上机,因为不同细胞系的蛋白质组差异较大,放在一起上机会影响后续定量。当然单纯从实验技术角度考虑是可以做的,但是后续数据可靠性无法保证,因此这种情况售前一定要沟通清楚。
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