1.快:尽快洗净或处理,处理后尽快冷冻。细胞可以直接用Trizol裂解后冷冻,组织洗净后、分小块后直接冷冻。(RNA Later®有帮助,注意组织要薄或小)
2.低温:先浸入液氮,数小时后再放入-70或-80度超低温冰箱更佳。超低温冰箱可以保存数月至一年,-20度不宜久存
3.避免温度波动:一台经常开关门,温度上下波动的-80度冰箱,可能还不如一台稳定在-40度的冰箱。
4.其他:推荐进口冻存管,标签冷冻后容易破碎,不如自己记号笔标记。
常规建议:
1.均一的样本:如细胞系,处理vs不处理,各3~4/组
2.较均一的样本:如成系的动物,处理vs不处理,各5~8/组
3.不均一的成对样本:如多例病人,同一人的癌和癌旁,~20/组
4.不均一的不成对样本:如多例病人组织vs正常人组织。~40/组
mRNA水平研究方法 |
高/低通量 |
一次实验检测基因数 |
Northern-blot、RT-PCR等 |
低通量 |
一个基因 |
功能分类PCR芯片 |
相对高通量 |
84或370个基因 |
全基因组表达谱芯片 |
高通量 |
几万个基因 |
mRNA高通量测序 |
高通量 |
几万个基因 |
组织:根据实验目的选择最合适的组织mRNA丰富、完整,最能代表难获取
注意:待研组织的占比
细胞:培养或分离的细胞处理简单,代表性略弱
血液、体液:血液、体液中游离的mRNA极少--不够量,易降解—不完整,不具有代表性
分离细胞——注意量
一般需要5E+6~5E+7 cells,或0.5*0.5*0.5 cm组织;0.5 ~2μg总RNA
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